20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5590 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  91.51 
 
 
137 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  38.24 
 
 
273 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  36.46 
 
 
235 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  35.47 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  31.5 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  30.73 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  31.19 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.37 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  32.05 
 
 
163 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  32.38 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  25.18 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  25.47 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  27.73 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  51.11 
 
 
62 aa  45.8  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  23.37 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  43.42 
 
 
152 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  28.36 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>