33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06223 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  36.71 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  38.16 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  40.44 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  33.09 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  28.1 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  28.1 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  27.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.37 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  24.52 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  25.43 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  25.43 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  25.43 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  25.43 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  25.45 
 
 		 126 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  26.78 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  23.08 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  23.08 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  25.79 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  24.19 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  24.19 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  25.25 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  21.88 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  23.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  25.47 
 
 		 235 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  24.26 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  24.82 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  26.5 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  30.84 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3486  Tn7-like transposition protein A  24.76 
 
 		 272 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696924  normal  0.106668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>