28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2525 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  99.07 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  75.81 
 
 		 215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  75.81 
 
 		 215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  78.14 
 
 		 214 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  51.03 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  39.62 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  37.07 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  33.97 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  34.2 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  34.2 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  33.03 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  23.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  23.98 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  31.48 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  26.21 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  28.66 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  26.87 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  24.19 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  26.83 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  29.76 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  28.68 
 
 		 201 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>