46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0692 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  31.22 
 
 
220 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  27.62 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  31.86 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  25.91 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  25.64 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  25.64 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  31.66 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  23.98 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  23.98 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  30.66 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  31.29 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  26.19 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  28.1 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  36.28 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  25.82 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  25.28 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  28.3 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  29.03 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  23.14 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  37.93 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  37.93 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  37.93 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  28.81 
 
 
206 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  21.31 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  37.04 
 
 
126 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  25.62 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  25.62 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  30.14 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  29.76 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  29.76 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  33.85 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  30.21 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  32.93 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  32.91 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  23.89 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  28.38 
 
 
886 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  29.13 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  30.56 
 
 
247 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0182  Tn7-like transposition protein A  24.55 
 
 
277 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>