42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1648 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  43.69 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  37.07 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  36.59 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  34.55 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  37.07 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  37.07 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  37.56 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  37.56 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  41.78 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  33 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  33 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  29.9 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  32.82 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  31.86 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  31.86 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  32.34 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  32.34 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  32.34 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  32.34 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  32.58 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  30.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  24.66 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0014  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.57 
 
 		 886 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  23.92 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 905 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  44.93 
 
 		 126 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 905 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 905 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 905 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 905 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  42.11 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  27.5 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  26.5 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  31.62 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  26.63 
 
 		 922 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  22.64 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  33.04 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  22.64 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>