17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4718 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  34.72 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  32.76 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  35.47 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  35.47 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  31.18 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  28.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  35.59 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  29.75 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  29.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  26.17 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  39.6 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  26.7 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  25.69 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  24.88 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  24.43 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>