22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3223 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  63.76 
 
 
223 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  62.26 
 
 
163 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  55.49 
 
 
255 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  34.2 
 
 
273 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  35.12 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  30.22 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  31.07 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  31.07 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  31.45 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  26.67 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  26.67 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  27 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  27.75 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  37.31 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  42.68 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  27.36 
 
 
214 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  32.53 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  32.53 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  56.41 
 
 
62 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  29.35 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  20.87 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>