31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1679 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  76.74 
 
 		 215 aa  338  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  82.33 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  75.81 
 
 		 215 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  40.83 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  50.34 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  37.07 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  33.18 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  35.75 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  35.75 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  33.18 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  34.65 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  28.06 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  25.64 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  25.64 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  28.85 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  28.29 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  27.31 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  27.31 
 
 		 246 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  27.14 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1632  hypothetical protein  29.84 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  26.84 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4719  hypothetical protein  27.81 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.102384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  28.65 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  26.29 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  26.29 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>