13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3184 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  322  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  320  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  62.26 
 
 
246 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  45.52 
 
 
255 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  35.37 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  32.3 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  28.86 
 
 
235 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  32.05 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  32.05 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  29.03 
 
 
276 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  37.58 
 
 
275 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  28.65 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  28.65 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>