28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0221 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  27.57 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  24.89 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  30.66 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  30.66 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  34.88 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  25.87 
 
 
220 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0024  hypothetical protein  42.86 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  29.3 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  24.12 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  24.12 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  32.58 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  28.66 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  25.35 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  27.14 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  27.14 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  28.05 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  24.84 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  26.83 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  26.79 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  25.41 
 
 
235 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>