30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0186 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  39.55 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  37.56 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0201  TnsA endonuclease  34.72 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  33.97 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  33.49 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2506  transposon transposase protein A, putative  35.32 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2137  TnsA endonuclease  35.32 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0160044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0059  hypothetical protein  37.19 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  33.18 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  33.18 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1581  TnsA endonuclease  35.27 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0142354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  43.36 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  36.94 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  36.94 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  36.94 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  36.94 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  28.91 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  25.82 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  25.82 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  26.78 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0221  TnsA endonuclease  28.05 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136583  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  30.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  27.15 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  23.66 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4719  hypothetical protein  20.93 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.102384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>