19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0614 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0614  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466174  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3184  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  320  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00624099  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3223  hypothetical protein  63.76 
 
 
246 aa  267  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.384792  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  51.91 
 
 
255 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  37.56 
 
 
273 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  31.07 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5590  hypothetical protein  31.5 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.76216  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5418  hypothetical protein  31.5 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.652513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  30.1 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4718  hypothetical protein  28.8 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3576  hypothetical protein  39.59 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4354  hypothetical protein  47.56 
 
 
152 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1679  TnsA endonuclease  28.29 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2937  TnsA endonuclease  28.29 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4981  TnsA endonuclease  27.49 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0242609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05440  hypothetical protein  53.85 
 
 
62 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2525  TnsA endonuclease  27.49 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  23.92 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5728  hypothetical protein  36.26 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.046672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>