22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0005 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  259  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  32.22 
 
 
208 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  25.45 
 
 
206 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0283  S-layer domain protein  39.51 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0179  S-layer-like domain-containing protein  39.51 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  28.83 
 
 
210 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  34.26 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  38.32 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2434  hypothetical protein  33.75 
 
 
255 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  44.93 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  31.87 
 
 
247 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  28.74 
 
 
273 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  40.7 
 
 
999 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0015  hypothetical protein  27.42 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  30.26 
 
 
209 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>