29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2236 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  100 
 
 
210 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  33.09 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  32.61 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  32.82 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  37.3 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  25.28 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  25.28 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  30.71 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  30.71 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  32.58 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  25.93 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  30.71 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  29 
 
 
149 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  30.91 
 
 
217 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  28.83 
 
 
126 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  26.09 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3149  hypothetical protein  27.74 
 
 
335 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6542  hypothetical protein  28.23 
 
 
211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5053  hypothetical protein  27.74 
 
 
367 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734373  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5219  hypothetical protein  27.74 
 
 
367 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  26.24 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3933  hypothetical protein  29.03 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4424  hypothetical protein  30.14 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  24.19 
 
 
197 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>