16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3863 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3863  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.927156  hitchhiker  0.00981642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4201  hypothetical protein  92.82 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  42.78 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  38.16 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  29.56 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2236  TnsA endonuclease  36 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000748139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06968  hypothetical protein  28.79 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1221  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1345  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2170  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2649  hypothetical protein  32.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0941676  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  24.26 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2601  hypothetical protein  27.2 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244034  normal  0.833439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0126  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  28.87 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2178  hypothetical protein  25.58 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>