10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0071 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0071  lipoprotein, putative  100 
 
 		 245 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0207  putative lipoprotein  93.88 
 
 		 245 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5553  putative lipoprotein  58.54 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4392  hypothetical protein  54.55 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.080014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70490  putative lipoprotein  51.63 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6116  putative lipoprotein  52.81 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5213  hypothetical protein  51.23 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0169  lipoprotein  50.82 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0321974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5352  lipoprotein  52.46 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106911  normal  0.257814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5304  putative lipoprotein  51.23 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.152301 
 
 
-
 
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