18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0050 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  53.72 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  53.72 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  36.81 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  36.59 
 
 		 423 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  32.33 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  30.47 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  29.16 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  31.21 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  30.64 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  25.78 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  27.36 
 
 		 419 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  26.76 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  25.55 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  26.78 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  23.83 
 
 		 370 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09610  hypothetical protein  24.18 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385464  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4880  hypothetical protein  23.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>