25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0060 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0060    100 
 
 		 567 bp  1124    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  88.51 
 
 		 1494 bp  597  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  81.56 
 
 		 1491 bp  111  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  80.66 
 
 		 1491 bp  95.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  82.39 
 
 		 1497 bp  93.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  87.37 
 
 		 1494 bp  93.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  81.82 
 
 		 1491 bp  89.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  90 
 
 		 1491 bp  83.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  90 
 
 		 1488 bp  71.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  93.62 
 
 		 1515 bp  69.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  80.12 
 
 		 1494 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  95 
 
 		 1539 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 1545 bp  56  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  96.77 
 
 		 1551 bp  54  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  89.36 
 
 		 1539 bp  54  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3762    96.77 
 
 		 701 bp  54  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3623  magnesium chelatase, ChlI subunit  96.77 
 
 		 681 bp  54  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0952268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  89.36 
 
 		 1539 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 1515 bp  50.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  90.24 
 
 		 1533 bp  50.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  90.24 
 
 		 1521 bp  50.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1923  magnesium chelatase ChlI subunit  90 
 
 		 921 bp  48.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  90 
 
 		 1539 bp  48.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3782  Mg chelatase, subunit ChlI  87.5 
 
 		 1500 bp  48.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121114  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  96.43 
 
 		 1710 bp  48.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>