140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1948 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1948  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 610 aa  1211    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.584968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  59.49 
 
 		 2914 aa  90.5  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  54.88 
 
 		 2851 aa  88.6  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4354  hypothetical protein  34.57 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23814  normal  0.363357 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  53.01 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.26 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.81 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  56.25 
 
 		 643 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.81 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.81 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  47.83 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.07 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  54.43 
 
 		 1426 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  55.41 
 
 		 295 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  55.84 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  55.56 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  58.11 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  52.56 
 
 		 283 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  55.56 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0990  hypothetical protein  34 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  57.14 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  60.81 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  51.69 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1860  hypothetical protein  31.29 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  51.69 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.35 
 
 		 523 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  56.25 
 
 		 1101 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  38.13 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.95 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  51.76 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  42.11 
 
 		 240 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  51.81 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0763  hypothetical protein  27.33 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  52.7 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  52.7 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  51.35 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  53.85 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  55.71 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  49.35 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  56.76 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  46.34 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  35.11 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  45 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  48.68 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  31.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  57.38 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  42.71 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  55.41 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  48.68 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  54.29 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  47.95 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  51.43 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  52 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  33.33 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  40.95 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  49.32 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  46.91 
 
 		 380 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  52.7 
 
 		 842 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  45.07 
 
 		 369 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1947  hypothetical protein  34.31 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.326308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  49.3 
 
 		 580 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  56.9 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  53.42 
 
 		 748 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  58.33 
 
 		 346 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.37 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  48.65 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  57.53 
 
 		 867 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 390 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  36.54 
 
 		 717 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  49.32 
 
 		 936 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  27.27 
 
 		 426 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  48.86 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  38.24 
 
 		 767 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  52 
 
 		 606 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  44.58 
 
 		 474 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  55.71 
 
 		 442 aa  54.7  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  47.31 
 
 		 158 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2550  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1471 aa  54.3  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0217864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  45.95 
 
 		 524 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  50 
 
 		 285 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  54.24 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  53.01 
 
 		 934 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.48 
 
 		 319 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  53.42 
 
 		 1168 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.65 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  52.05 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  67.35 
 
 		 221 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  54.39 
 
 		 303 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.25 
 
 		 835 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  42.34 
 
 		 322 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  55 
 
 		 953 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.04 
 
 		 473 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  45.92 
 
 		 542 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  48.44 
 
 		 730 aa  51.2  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  51.95 
 
 		 639 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.65 
 
 		 647 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1859  hypothetical protein  26.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1147 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  52.73 
 
 		 558 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55.22 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>