32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4354 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 864 aa  1723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23814  normal  0.363357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1948  Collagen triple helix repeat protein  34.75 
 
 		 610 aa  80.5  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.584968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0990  hypothetical protein  32.48 
 
 		 628 aa  62  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46.03 
 
 		 2851 aa  60.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.52 
 
 		 2914 aa  60.1  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1860  hypothetical protein  27.61 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1515  hypothetical protein  26.28 
 
 		 873 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1870  hypothetical protein  30.06 
 
 		 312 aa  53.5  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00769715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  56.45 
 
 		 283 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  66 
 
 		 222 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1947  hypothetical protein  35.63 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.326308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.15 
 
 		 523 aa  50.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3050  hypothetical protein  37.8 
 
 		 309 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  52.94 
 
 		 295 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  52.38 
 
 		 344 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  57.45 
 
 		 1426 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  53.06 
 
 		 437 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  53.06 
 
 		 439 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  63.04 
 
 		 253 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  53.19 
 
 		 644 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  51.67 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  63.41 
 
 		 1089 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  41.86 
 
 		 194 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1139  hypothetical protein  22.25 
 
 		 419 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50.79 
 
 		 582 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  34.43 
 
 		 288 aa  45.8  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  49.09 
 
 		 366 aa  45.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  50.98 
 
 		 283 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  50.94 
 
 		 936 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  56.36 
 
 		 767 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0763  hypothetical protein  25.85 
 
 		 414 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  41.77 
 
 		 730 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>