More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1682 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 604 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  85.02 
 
 		 601 aa  1033    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  75.8 
 
 		 600 aa  906    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  72.03 
 
 		 598 aa  863    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  64.86 
 
 		 598 aa  800    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  72.96 
 
 		 599 aa  885    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 		 579 aa  755    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 592 aa  895    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  61.29 
 
 		 584 aa  732    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  71.28 
 
 		 590 aa  863    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  72.93 
 
 		 590 aa  851    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  73.28 
 
 		 609 aa  890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  68.42 
 
 		 578 aa  826    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 591 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 584 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 585 aa  773    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  66.11 
 
 		 607 aa  768    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 600 aa  1211    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  73.13 
 
 		 601 aa  880    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  81.97 
 
 		 591 aa  962    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 		 586 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  72.95 
 
 		 572 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  85.37 
 
 		 590 aa  998    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  80.95 
 
 		 592 aa  976    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 		 590 aa  856    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 		 610 aa  905    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  72.85 
 
 		 599 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 596 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  73.02 
 
 		 596 aa  890    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 592 aa  750    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  73.83 
 
 		 590 aa  892    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  73.3 
 
 		 604 aa  891    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  72.76 
 
 		 590 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  72.25 
 
 		 601 aa  851    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 1019 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 599 aa  808    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 594 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 600 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 590 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 599 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 602 aa  551  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 627 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 602 aa  549  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 595 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 606 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 599 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 589 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 599 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 605 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  541  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 591 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 619 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 591 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 592 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 590 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 623 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 591 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 591 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 593 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 597 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 588 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 596 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 596 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 585 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 623 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 607 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 610 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 583 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 594 aa  535  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 594 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 593 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 589 aa  535  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 597 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 584 aa  537  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 600 aa  538  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 618 aa  532  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 585 aa  532  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 594 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>