More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 591 aa  774    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 		 585 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  74.58 
 
 		 591 aa  889    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  76.92 
 
 		 598 aa  947    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 		 599 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 584 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 		 586 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  65.1 
 
 		 604 aa  792    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  63.48 
 
 		 579 aa  787    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 599 aa  752    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 607 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  75 
 
 		 590 aa  903    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 1019 aa  758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  75.38 
 
 		 592 aa  902    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 610 aa  1234    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  74.79 
 
 		 609 aa  909    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 		 601 aa  918    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  72.99 
 
 		 592 aa  899    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 		 600 aa  905    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  73.31 
 
 		 572 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  63.76 
 
 		 584 aa  772    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 590 aa  884    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 		 590 aa  893    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  69.65 
 
 		 599 aa  852    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  72.14 
 
 		 600 aa  903    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  59.5 
 
 		 598 aa  741    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 596 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  70.58 
 
 		 601 aa  874    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  72.32 
 
 		 596 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 578 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  74.84 
 
 		 604 aa  923    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 592 aa  790    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  75.93 
 
 		 590 aa  911    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  73.11 
 
 		 590 aa  885    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 		 601 aa  879    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  72.8 
 
 		 590 aa  888    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 600 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 594 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 599 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 599 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 590 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 592 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 597 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 592 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 606 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 617 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 610 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 594 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 623 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 602 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 598 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 591 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 602 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 602 aa  571  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 595 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 592 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 623 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 594 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 600 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 590 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 597 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 596 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 594 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 599 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 585 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 600 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 598 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 590 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 626 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 588 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>