More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2007 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3040  aspartyl-tRNA synthetase  72.26 
 
 		 598 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.986896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  63.49 
 
 		 604 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 607 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3090  aspartyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 		 584 aa  715    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.904457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 		 590 aa  851    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12420  aspartyl-tRNA synthetase  70.58 
 
 		 610 aa  874    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0974797  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 1019 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12790  aspartyl-tRNA synthetase  71.64 
 
 		 604 aa  880    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.759255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 584 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2086  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 579 aa  742    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14070  aspartyl-tRNA synthetase  70.67 
 
 		 609 aa  861    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3335  aspartyl-tRNA synthetase  72.15 
 
 		 599 aa  842    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540844  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1809  aspartyl-tRNA synthetase  79.6 
 
 		 591 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0253979  normal  0.442001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0018  aspartyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 599 aa  795    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0678505  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0785  aspartate--tRNA ligase  64.99 
 
 		 598 aa  795    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2314  aspartyl-tRNA synthetase  73.15 
 
 		 600 aa  867    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2347  aspartyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 		 590 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.138721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2007  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 601 aa  1211    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116026  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 		 578 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2308  aspartyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 572 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  71.69 
 
 		 592 aa  859    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  63.67 
 
 		 591 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3785  aspartyl-tRNA synthetase  70.38 
 
 		 590 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1963  aspartyl-tRNA synthetase  73.49 
 
 		 601 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12592  aspartyl-tRNA synthetase  69.62 
 
 		 596 aa  825    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.743404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17620  aspartyl-tRNA synthetase  82.8 
 
 		 590 aa  967    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0256877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1359  aspartyl-tRNA synthetase  77.78 
 
 		 592 aa  941    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340655  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2291  aspartyl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 596 aa  872    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2022  aspartyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 		 599 aa  874    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000279536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1334  aspartyl-tRNA synthetase  63.65 
 
 		 592 aa  749    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.455738  normal  0.523529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2398  aspartyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 590 aa  883    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.946352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 586 aa  766    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2355  aspartyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 590 aa  824    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 585 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2615  aspartyl-tRNA synthetase  70.02 
 
 		 601 aa  832    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1682  aspartyl-tRNA synthetase  85.02 
 
 		 600 aa  1033    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 602 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 590 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 599 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 600 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 599 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 586 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 598 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 595 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 596 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 596 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 606 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 599 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 601 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 594 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 594 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 597 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 596 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 593 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 594 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 597 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 627 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 591 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 593 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 597 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 590 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 585 aa  535  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 591 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 619 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 614 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 593 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 591 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 590 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 602 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 594 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 597 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 584 aa  530  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 618 aa  529  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 617 aa  525  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 600 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 612 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 598 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 595 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 609 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 590 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 598 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 608 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 626 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 591 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 612 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.403344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>