More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2354 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18791  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
598 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
591 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
597 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18201  aspartyl-tRNA synthetase  62.4 
 
 
606 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
591 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
599 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 
612 aa  787    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 
597 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 
614 aa  1016    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
594 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
589 aa  646    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 
596 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  76.81 
 
 
626 aa  972    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2233  aspartyl-tRNA synthetase  62.4 
 
 
610 aa  777    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 
609 aa  799    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  80.13 
 
 
597 aa  1009    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1781  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
598 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  75.55 
 
 
599 aa  954    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
600 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
608 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
600 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
594 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  76.6 
 
 
618 aa  977    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  639    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
585 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  76.81 
 
 
598 aa  974    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
595 aa  1219    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
586 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  75.13 
 
 
595 aa  967    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
591 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29551  aspartyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 
606 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 
612 aa  785    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.403344 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
598 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18791  aspartyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
602 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
590 aa  663    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
599 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
591 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16561  predicted protein  52.68 
 
 
623 aa  632  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0953344  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
602 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
593 aa  631  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
589 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
594 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
593 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
588 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
592 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
592 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
593 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
594 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
595 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
592 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
594 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 
598 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
617 aa  621  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
590 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
597 aa  614  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
594 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
598 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
596 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
607 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
593 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
594 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
606 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
588 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
588 aa  608  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
588 aa  608  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 
589 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
590 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
613 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
605 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
619 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
627 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
588 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
600 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
623 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
595 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
601 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
592 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
623 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
600 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
598 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
596 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
592 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
587 aa  599  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
596 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
594 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 
605 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
599 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
593 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
601 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
599 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
608 aa  595  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
598 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>