More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3786 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 598 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 594 aa  634    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 594 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 593 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 594 aa  736    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 608 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 585 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  78.42 
 
 		 588 aa  947    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 592 aa  687    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 598 aa  693    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 600 aa  649    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 589 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 597 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 589 aa  1202    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 593 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 600 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 600 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 586 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 593 aa  654    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 603 aa  681    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 598 aa  685    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 595 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 592 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  92.53 
 
 		 589 aa  1133    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 601 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 590 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 589 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 596 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 598 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 594 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 627 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 590 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 592 aa  608  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 619 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 613 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 614 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 597 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 598 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 597 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 595 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 587 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 590 aa  582  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4178  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 589 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 602 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 618 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 598 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 626 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 616 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 589 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 610 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 595 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 583 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 579 aa  569  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 581 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 596 aa  569  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 599 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 588 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 614 aa  568  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 587 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 582 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 617 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 602 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 582 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 602 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>