More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1484 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
588 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
592 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
594 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
598 aa  646    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
600 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
588 aa  651    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
591 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 
590 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
602 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
594 aa  656    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 
593 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
590 aa  669    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
593 aa  640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
596 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
594 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 
606 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
600 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
588 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 
627 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
593 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
608 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
595 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 
589 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  680    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
591 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
586 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
594 aa  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
591 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
587 aa  1200    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
613 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
593 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
598 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
594 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
592 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
591 aa  680    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
597 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
610 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
585 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
598 aa  630  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
602 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
592 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
614 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
597 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
588 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
600 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
596 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
595 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
617 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
594 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
594 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
607 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
592 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
599 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
590 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
596 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
599 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
597 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
597 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
597 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
596 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
596 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
597 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
583 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
598 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
591 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
600 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
595 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
599 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
623 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
623 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
599 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
600 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
605 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
595 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
599 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
614 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
594 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
600 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
626 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
600 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
598 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
600 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
592 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
598 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
602 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
605 aa  594  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>