More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1673 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
588 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 
589 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
600 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
596 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 
594 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 
594 aa  701    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
591 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 
600 aa  769    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
588 aa  676    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
599 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
605 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
591 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
590 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 
589 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 
623 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 
591 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 
591 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
591 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
591 aa  695    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
591 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
593 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
593 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
591 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 
603 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
599 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 
595 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
602 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
597 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
600 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
598 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 
595 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
591 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
596 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 
585 aa  739    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  64.36 
 
 
601 aa  753    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 
594 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
606 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 
593 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
591 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
600 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
596 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 
588 aa  695    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 
600 aa  760    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
600 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 
593 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
594 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
594 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
601 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
599 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
592 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
591 aa  695    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
588 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 
602 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
600 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
591 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
599 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
597 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  55 
 
 
597 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 
602 aa  696    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 
599 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
597 aa  709    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 
592 aa  725    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
592 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
593 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
586 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
591 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
598 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 
590 aa  741    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
614 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
598 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
583 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
623 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 
613 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
599 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 
607 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
599 aa  653    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
627 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
588 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
594 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 
592 aa  721    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
617 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
601 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
589 aa  698    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
599 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
610 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
594 aa  727    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
605 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 
603 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
600 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 
604 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>