More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1946 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 588 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 593 aa  720    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 594 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 597 aa  695    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 594 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 588 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 591 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 		 588 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 627 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 591 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 591 aa  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 591 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 600 aa  676    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 597 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 593 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 589 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 591 aa  714    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 596 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 594 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 606 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 594 aa  815    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 591 aa  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 608 aa  746    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 601 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 591 aa  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 600 aa  731    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 589 aa  721    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 594 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 594 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 619 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 591 aa  707    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 598 aa  824    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 592 aa  722    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 589 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 587 aa  640    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 597 aa  795    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 597 aa  792    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 582 aa  652    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 590 aa  723    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 593 aa  1229    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 591 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 586 aa  721    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 585 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 588 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 592 aa  790    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 613 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  75.17 
 
 		 595 aa  947    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 591 aa  714    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 		 600 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 594 aa  718    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 602 aa  672    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 598 aa  713    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 599 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 590 aa  699    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 610 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 593 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 582 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 597 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 599 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 599 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 599 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 614 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 597 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 600 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 592 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 623 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 592 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 592 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 605 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 605 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 595 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>