More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0150 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 600 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 597 aa  696    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 594 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 592 aa  665    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 591 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 588 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 599 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 591 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 589 aa  646    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 627 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 593 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 591 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 591 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 591 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 590 aa  694    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 588 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 591 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 592 aa  666    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 597 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 591 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 595 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 592 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 596 aa  708    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 595 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 597 aa  689    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 594 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 606 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 591 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 593 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 614 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 588 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 600 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 593 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 592 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 594 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 602 aa  1223    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 594 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 587 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 598 aa  716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 598 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 594 aa  690    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 597 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 597 aa  673    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 596 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 592 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 586 aa  682    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 601 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 593 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 591 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 596 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 598 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 594 aa  705    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 590 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 613 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 594 aa  660    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 607 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 588 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 585 aa  695    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 594 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 608 aa  685    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 617 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 610 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 590 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 599 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 591 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 599 aa  633  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 599 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 592 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 600 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 591 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 602 aa  626  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 595 aa  623  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 604 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 599 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 619 aa  621  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 591 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 599 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 589 aa  621  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 599 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 595 aa  621  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 593 aa  621  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 605 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 592 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 611 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>