More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0812 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 600 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 594 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 592 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 588 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 599 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 588 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 599 aa  663    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  722    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 614 aa  690    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 597 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 591 aa  718    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 596 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 600 aa  678    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 599 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 590 aa  723    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 589 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 597 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 594 aa  654    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 595 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 585 aa  722    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 596 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 595 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 598 aa  660    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 594 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 606 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 598 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 596 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 590 aa  746    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 599 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 588 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 600 aa  737    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 587 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 617 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 608 aa  781    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 602 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 594 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 602 aa  682    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 597 aa  704    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 592 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 598 aa  686    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 597 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 597 aa  678    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 595 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 588 aa  672    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 592 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 593 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 586 aa  1199    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 592 aa  753    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 591 aa  712    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 592 aa  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 594 aa  735    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 589 aa  720    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 627 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 613 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 588 aa  697    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 		 594 aa  754    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 593 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 601 aa  698    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 594 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 593 aa  703    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 596 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 589 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  722    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 610 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 593 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 597 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 602 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 607 aa  632  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 626 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 597 aa  631  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 595 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 602 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 598 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 595 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 598 aa  624  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 618 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 594 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 605 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 593 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 599 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 600 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 619 aa  621  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 623 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 594 aa  618  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>