More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2350 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 600 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 593 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 585 aa  635    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 594 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 594 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 619 aa  1248    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 590 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 608 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 593 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 592 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 613 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 627 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 595 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 591 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 593 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 591 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 593 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 591 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 598 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 594 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 602 aa  621  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 586 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 589 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 590 aa  617  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 597 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 592 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 600 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 603 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 588 aa  611  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 589 aa  611  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 601 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 588 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 595 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 616 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 626 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 614 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 603 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 618 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 603 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 603 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 582 aa  597  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 595 aa  596  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 597 aa  597  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 592 aa  595  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 597 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 583 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 599 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 582 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 589 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 599 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 614 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 594 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 618 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 588 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18791  aspartyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 602 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 600 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 597 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 609 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 599 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 596 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 581 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18981  aspartyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 598 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 579 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1204  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00717108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 589 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 580 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 587 aa  580  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 623 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 579 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 601 aa  581  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 595 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>