More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0945 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
598 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
593 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  74.02 
 
 
591 aa  910    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
594 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  73.91 
 
 
591 aa  889    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
593 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 
588 aa  788    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
593 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  74.02 
 
 
591 aa  908    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
592 aa  642    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
589 aa  641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
583 aa  700    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 
585 aa  747    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
614 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  73.34 
 
 
591 aa  904    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  73.59 
 
 
591 aa  903    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  73.34 
 
 
591 aa  904    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
590 aa  1189    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 
603 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
619 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  64.9 
 
 
588 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
608 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
597 aa  720    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
600 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 
596 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  73.59 
 
 
591 aa  903    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
597 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
594 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 
606 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  73.34 
 
 
591 aa  904    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  64.9 
 
 
588 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
599 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 
600 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 
598 aa  658    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
601 aa  673    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
594 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 
591 aa  904    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
627 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
595 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  73.76 
 
 
589 aa  905    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
598 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
598 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
597 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
597 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  82.13 
 
 
594 aa  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
595 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
594 aa  726    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 
592 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
626 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 
586 aa  746    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
592 aa  737    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
593 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
590 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
591 aa  675    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
617 aa  659    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
591 aa  644    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 
583 aa  707    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 
589 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 
588 aa  639    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
613 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
595 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
607 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
597 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
602 aa  659    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  61.56 
 
 
600 aa  757    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 
594 aa  691    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 
600 aa  686    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 
590 aa  731    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  73.51 
 
 
591 aa  904    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 
582 aa  638    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
610 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
592 aa  738    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
597 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
587 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
597 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
617 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
594 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
618 aa  628  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
599 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 
614 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
588 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
592 aa  628  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
590 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
595 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
594 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
589 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
596 aa  621  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 
599 aa  621  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
596 aa  621  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2595  aspartyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 
609 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.325867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
596 aa  619  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 
623 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
605 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
593 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
599 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
623 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 
592 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
600 aa  618  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
594 aa  618  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
600 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>