More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1948 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 588 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 588 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 591 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 591 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  85.66 
 
 		 583 aa  1053    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 597 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 591 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 591 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 591 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 594 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 591 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 591 aa  718    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 606 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 591 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 590 aa  707    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 594 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 588 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  70.77 
 
 		 590 aa  835    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 591 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 617 aa  673    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 583 aa  1194    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 591 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 591 aa  717    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 613 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 589 aa  712    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 600 aa  684    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 597 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 593 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 597 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 585 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 596 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 591 aa  625  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 600 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 598 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 610 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 594 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 595 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 594 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 627 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 593 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 614 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 602 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 592 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 600 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 592 aa  601  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 586 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 587 aa  595  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 617 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 597 aa  588  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 597 aa  590  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 588 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 599 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 602 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 587 aa  582  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 589 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 598 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 596 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 596 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 623 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  50 
 
 		 590 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 590 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 598 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 598 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 591 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 601 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 		 605 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 598 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 594 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 590 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 602 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 590 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>