More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2188 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 594 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 587 aa  635    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 589 aa  720    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 588 aa  690    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 589 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 591 aa  718    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 591 aa  719    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 591 aa  719    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 591 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 591 aa  719    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 591 aa  719    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 597 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 592 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 593 aa  795    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 590 aa  725    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 591 aa  720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 596 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 582 aa  644    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 594 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 606 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 602 aa  673    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 591 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 608 aa  709    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 588 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 594 aa  734    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 		 600 aa  710    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 593 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 592 aa  776    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 597 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 627 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 593 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 594 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1222    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  99.83 
 
 		 597 aa  1219    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 601 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 593 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 586 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 585 aa  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 598 aa  756    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 617 aa  643    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 600 aa  733    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 598 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 613 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 594 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 591 aa  719    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 600 aa  641    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 588 aa  673    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 595 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 590 aa  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 591 aa  710    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 600 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 583 aa  633  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 583 aa  626  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 614 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 602 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 599 aa  611  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 588 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 589 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 595 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 592 aa  608  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 603 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 597 aa  608  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 587 aa  606  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 597 aa  607  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 592 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 595 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 599 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 599 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 599 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 589 aa  599  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 592 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  0.000000115872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 592 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 592 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 592 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 592 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 592 aa  595  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 616 aa  598  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 599 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  597  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 617 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 619 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 581 aa  594  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 593 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 591 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>