More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0950 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 589 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 598 aa  682    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 585 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 588 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 598 aa  691    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 603 aa  1237    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 594 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 600 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 600 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 598 aa  683    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 589 aa  636    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 592 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 590 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 592 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 600 aa  691    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 601 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 589 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 597 aa  663    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 590 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 594 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 586 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 608 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 593 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 593 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 593 aa  622  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 602 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 591 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 589 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 594 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 591 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 596 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 619 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 597 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 594 aa  611  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 597 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 595 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 590 aa  603  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 592 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 599 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 596 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 613 aa  601  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 588 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 588 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 599 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 602 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 595 aa  595  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 599 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 627 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 606 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 588 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 592 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 604 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 605 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 623 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 591 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 599 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 591 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 599 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 582 aa  576  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 590 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 598 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 617 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 599 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>