More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12140 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
591 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
600 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
591 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 
600 aa  675    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
594 aa  711    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
591 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
591 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
596 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
588 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
599 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
605 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
591 aa  715    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
597 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
590 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
592 aa  766    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
602 aa  694    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
591 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
591 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
591 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
591 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
600 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
593 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
593 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
591 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
591 aa  711    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
599 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
598 aa  708    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
600 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 
602 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
597 aa  698    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
588 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
598 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
595 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
591 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
596 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 
600 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
600 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
596 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
594 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
606 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
599 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
591 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
591 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
589 aa  710    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
585 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
588 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
600 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
600 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 
600 aa  648    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
599 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
611 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 
594 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
594 aa  698    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
601 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
599 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
600 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
591 aa  711    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 
591 aa  713    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
602 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
600 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
617 aa  667    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
600 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
600 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
593 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
592 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
595 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
597 aa  725    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
597 aa  723    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
614 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 
601 aa  705    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
599 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
597 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
592 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
599 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 
586 aa  723    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
600 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  54.75 
 
 
591 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
600 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
591 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
617 aa  635    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
600 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
598 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
600 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
600 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 
613 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
588 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 
607 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
623 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
604 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
591 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 
594 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
593 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
591 aa  705    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
600 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
599 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
599 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
610 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
604 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 
605 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
603 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>