More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0466 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  79.73 
 
 		 599 aa  1013    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 594 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 591 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 598 aa  714    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 592 aa  725    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 599 aa  749    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 605 aa  1248    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 591 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 601 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 610 aa  691    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000968757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 598 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 591 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 591 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 591 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 595 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 593 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 593 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 591 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 		 608 aa  744    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  73.36 
 
 		 599 aa  916    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 591 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 593 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  87.46 
 
 		 602 aa  1109    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 597 aa  851    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 598 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 595 aa  753    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 591 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 596 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  85.52 
 
 		 600 aa  1074    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 591 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 595 aa  706    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 594 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 596 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 591 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 		 597 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 593 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 		 588 aa  874    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  86.03 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  86.36 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 601 aa  746    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  76.56 
 
 		 611 aa  975    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 		 594 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  70.44 
 
 		 594 aa  886    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  79.7 
 
 		 601 aa  1004    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  84.4 
 
 		 599 aa  1063    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 593 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 592 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 		 608 aa  742    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  88.65 
 
 		 602 aa  1122    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  78.31 
 
 		 600 aa  999    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 590 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  85.52 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 589 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 592 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 592 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 592 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 592 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 585 aa  711    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 597 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  63.82 
 
 		 592 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 591 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 598 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  85.69 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 591 aa  767    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 592 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 590 aa  744    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 591 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 590 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 590 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 600 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  85.52 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 591 aa  761    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  75.91 
 
 		 604 aa  963    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 607 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 		 591 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  81.51 
 
 		 599 aa  1016    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 591 aa  764    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 594 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 617 aa  761    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 591 aa  724    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 592 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 592 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 590 aa  694    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000012582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 599 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  79.6 
 
 		 604 aa  1016    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  80.03 
 
 		 605 aa  1005    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 		 603 aa  1008    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  85.86 
 
 		 600 aa  1075    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>