More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0341 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 590 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 590 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 600 aa  654    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 592 aa  718    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 594 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 591 aa  773    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  81.51 
 
 		 599 aa  1019    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  78.22 
 
 		 600 aa  1007    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  59.83 
 
 		 599 aa  748    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  98.34 
 
 		 605 aa  1233    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 591 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 601 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 589 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 598 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 591 aa  739    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 591 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 591 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 591 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 591 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 593 aa  712    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 593 aa  708    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 591 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  60.72 
 
 		 608 aa  752    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  73.52 
 
 		 599 aa  921    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 590 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 593 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  87.63 
 
 		 602 aa  1119    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 597 aa  847    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 595 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  85.69 
 
 		 598 aa  1079    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 595 aa  751    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 591 aa  774    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 596 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  85.23 
 
 		 600 aa  1078    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 591 aa  716    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 598 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 594 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 606 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 596 aa  746    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 591 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 597 aa  726    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 593 aa  713    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  70.83 
 
 		 588 aa  873    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 592 aa  728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  86.07 
 
 		 600 aa  1085    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 591 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  76.47 
 
 		 611 aa  984    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 594 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 		 594 aa  892    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  79.73 
 
 		 601 aa  1010    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  84.95 
 
 		 599 aa  1073    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 593 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 592 aa  742    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 		 608 aa  751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  89.32 
 
 		 602 aa  1133    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  85.74 
 
 		 600 aa  1085    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 592 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  85.23 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  59.93 
 
 		 592 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 591 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 592 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 592 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 610 aa  690    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000968757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 		 585 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 597 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 591 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 591 aa  737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  63.82 
 
 		 592 aa  776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 591 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 590 aa  693    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000012582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  85.4 
 
 		 600 aa  1081    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 591 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 592 aa  732    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 590 aa  744    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 591 aa  773    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 590 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 590 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  85.23 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 590 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  75.66 
 
 		 604 aa  969    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 591 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 601 aa  757    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 590 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 594 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 		 617 aa  760    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 591 aa  729    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 		 599 aa  1016    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 592 aa  723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 598 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 599 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 610 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 		 604 aa  1022    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  79.47 
 
 		 605 aa  1014    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  79.56 
 
 		 603 aa  1007    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  85.57 
 
 		 600 aa  1080    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>