More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0724 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 593 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 590 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 588 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 583 aa  672    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 594 aa  687    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 600 aa  1235    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 606 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 588 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 594 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 589 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 585 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 597 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 597 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 590 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 597 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 593 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 591 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 591 aa  741    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 617 aa  728    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 591 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 583 aa  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 593 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 598 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 588 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 591 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 595 aa  631  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 593 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 594 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 594 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 627 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 596 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 602 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 598 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 613 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 597 aa  611  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 598 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 586 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 610 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 595 aa  589  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 589 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 623 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 623 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 605 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 596 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 592 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 599 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 596 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 617 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 602 aa  585  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 582 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 592 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 587 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 599 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 600 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 588 aa  581  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 602 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 592 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 584 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 599 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 590 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 619 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 599 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 594 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 593 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 598 aa  572  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 597 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 600 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 600 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>