More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1463 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 598 aa  704    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 599 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  81.96 
 
 		 593 aa  1035    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 601 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 594 aa  1219    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 591 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 589 aa  694    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 588 aa  675    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 599 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 605 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 591 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 616 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 592 aa  720    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 599 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 600 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 594 aa  650    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 591 aa  693    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 591 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 591 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 596 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 600 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 596 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 597 aa  764    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 599 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 588 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 602 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 597 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 594 aa  719    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 598 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 595 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 593 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 596 aa  869    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 591 aa  692    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 599 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  87.71 
 
 		 594 aa  1100    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 606 aa  755    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 590 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 591 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 614 aa  759    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 592 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 588 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 603 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 600 aa  718    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 600 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 603 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 617 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 603 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 623 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 594 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 601 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 599 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 589 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 588 aa  649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 603 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 602 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 627 aa  763    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 600 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 602 aa  734    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 600 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 590 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  80.34 
 
 		 598 aa  1009    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 597 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 597 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 591 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  78.41 
 
 		 593 aa  990    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 592 aa  717    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  78.25 
 
 		 593 aa  990    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 592 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 599 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 586 aa  697    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 623 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 600 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 594 aa  717    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 585 aa  716    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 595 aa  735    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 603 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 600 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 600 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 613 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 607 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 601 aa  696    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  79.22 
 
 		 594 aa  998    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 588 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 591 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 591 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 599 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 598 aa  764    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 610 aa  759    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 604 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 605 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>