More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0913 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 590 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 590 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 600 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 		 590 aa  776    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  72.95 
 
 		 591 aa  907    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 590 aa  770    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 599 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 588 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 599 aa  816    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 605 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 591 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 601 aa  780    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 595 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  70.83 
 
 		 590 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 591 aa  799    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  72.01 
 
 		 591 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 591 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 591 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 		 590 aa  776    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 593 aa  744    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 593 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  72.18 
 
 		 591 aa  908    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 608 aa  836    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 599 aa  767    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  72.95 
 
 		 591 aa  907    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  77.72 
 
 		 590 aa  965    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 602 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  63.76 
 
 		 597 aa  786    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  62.22 
 
 		 590 aa  776    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 598 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 595 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  72.77 
 
 		 591 aa  900    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 596 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 600 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 		 588 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 610 aa  730    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000968757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 592 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 606 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 596 aa  787    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 591 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 592 aa  787    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 592 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 589 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 588 aa  752    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 590 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 600 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 592 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 		 611 aa  723    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 594 aa  1222    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 594 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 601 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 599 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 		 593 aa  778    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  70.89 
 
 		 592 aa  862    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 608 aa  837    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 602 aa  715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 598 aa  782    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 617 aa  822    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 601 aa  833    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 599 aa  739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 		 592 aa  809    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 598 aa  781    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 592 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 585 aa  742    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  63.34 
 
 		 597 aa  796    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 591 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 591 aa  799    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  67.97 
 
 		 592 aa  827    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 		 591 aa  762    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  72.26 
 
 		 591 aa  899    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 600 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 591 aa  890    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 591 aa  786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 		 591 aa  925    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 		 592 aa  759    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 604 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 600 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  72.6 
 
 		 591 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 		 588 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 607 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 591 aa  800    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 593 aa  774    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 598 aa  781    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 590 aa  733    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000012582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 600 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 591 aa  783    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  63.57 
 
 		 592 aa  783    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 592 aa  765    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 600 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  73.63 
 
 		 599 aa  919    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 		 600 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 		 604 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 605 aa  760    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 		 603 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>