More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2079 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 		 590 aa  845    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 617 aa  762    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  69.78 
 
 		 598 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 591 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 604 aa  686    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 588 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 599 aa  757    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 		 605 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 623 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  73.2 
 
 		 601 aa  917    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  88.4 
 
 		 595 aa  1101    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 610 aa  728    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000968757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 591 aa  1038    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 591 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  67.97 
 
 		 590 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 598 aa  698    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 593 aa  734    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 593 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  63.79 
 
 		 591 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 608 aa  758    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 599 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  69.78 
 
 		 598 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  82.09 
 
 		 592 aa  1033    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 602 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 597 aa  680    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 598 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 		 595 aa  737    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 591 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 583 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 601 aa  770    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  82.09 
 
 		 592 aa  1033    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 600 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 596 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 599 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 590 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1218    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  87.5 
 
 		 595 aa  1095    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163507  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 588 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 590 aa  731    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000012582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 600 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  82.09 
 
 		 592 aa  1032    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 611 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  63.13 
 
 		 594 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 594 aa  700    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 601 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 599 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  82.34 
 
 		 593 aa  1032    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 592 aa  769    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 608 aa  762    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 602 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0315  aspartyl-tRNA synthetase  56.61 
 
 		 589 aa  707    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 591 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 600 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 599 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  69.09 
 
 		 591 aa  877    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 		 592 aa  921    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  90.14 
 
 		 597 aa  1114    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  848    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 600 aa  709    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 585 aa  842    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  69.65 
 
 		 593 aa  879    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 591 aa  1035    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 591 aa  1033    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 		 592 aa  773    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  81.42 
 
 		 591 aa  1019    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  71.4 
 
 		 592 aa  880    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 591 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 590 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 591 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 592 aa  1034    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 591 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 600 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 599 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  64.69 
 
 		 591 aa  812    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  82.26 
 
 		 591 aa  1035    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  68.48 
 
 		 590 aa  847    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 600 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 599 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  79.73 
 
 		 591 aa  1003    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  71.86 
 
 		 592 aa  901    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 600 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  64.36 
 
 		 599 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  69.78 
 
 		 598 aa  870    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 604 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 605 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 603 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>