More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1351 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
589 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
590 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
588 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1201    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
603 aa  711    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
590 aa  636    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 
589 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
592 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 
592 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
597 aa  634  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
598 aa  627  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 
600 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
600 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
586 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
594 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
598 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
598 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
594 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
594 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 
594 aa  611  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
601 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
593 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
585 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
596 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
595 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
593 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
605 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
594 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 
589 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
593 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
597 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
592 aa  600  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
602 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
598 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
605 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
606 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
608 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
594 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
608 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
589 aa  587  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
590 aa  587  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
604 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
595 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3016  aspartyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
596 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.187201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
597 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
595 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
587 aa  580  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
598 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 
613 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
588 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
595 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
597 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
619 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  50.16 
 
 
625 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
626 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
610 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
604 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 
598 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
614 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
598 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
604 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
604 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
599 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
600 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
627 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
617 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
607 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  49 
 
 
604 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
595 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
582 aa  564  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
592 aa  559  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
604 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
599 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
592 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
597 aa  561  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
599 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  561  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
593 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
593 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
599 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
594 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>