More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1587 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
590 aa  1211    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0453  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
586 aa  642    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
590 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
592 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
594 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
594 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
603 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
589 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
588 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
593 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
589 aa  596  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
588 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
591 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
594 aa  594  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
593 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
597 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
590 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
595 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
591 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
589 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
588 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
591 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
598 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
593 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
591 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
596 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
600 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 
594 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
593 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
588 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
602 aa  579  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
593 aa  578  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
585 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
608 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
592 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
586 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
583 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
583 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
593 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
597 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
606 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
592 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
594 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
597 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  0.000000115872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
619 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
592 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000667018  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
599 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
591 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
591 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
598 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
594 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
591 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
599 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
600 aa  553  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
588 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
598 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
599 aa  554  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
597 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1122  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
577 aa  551  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270961 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
595 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
617 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
579 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
594 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
599 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
598 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
597 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
579 aa  551  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
586 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
602 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
614 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
592 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
595 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
591 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
592 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
591 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
627 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
591 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>