More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1333 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 599 aa  655    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 576 aa  746    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  95.51 
 
 		 579 aa  1124    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 581 aa  722    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 579 aa  1170    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 592 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 595 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 594 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 592 aa  596  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  591  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 602 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 593 aa  586  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 619 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 585 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 595 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 597 aa  580  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 593 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 592 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 596 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 606 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 586 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 590 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 589 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 627 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 590 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 614 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 599 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 597 aa  565  1e-160  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 593 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 589 aa  567  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 613 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 599 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 599 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 603 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 610 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 626 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 591 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 597 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 614 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 599 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 597 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 589 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 597 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 601 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 599 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 590 aa  554  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 591 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 582 aa  555  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 597 aa  555  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 588 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 580 aa  551  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 599 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 586 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 617 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 594 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 618 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0582  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 599 aa  546  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 602 aa  544  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 599 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 598 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 582 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>