More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1621 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
579 aa  655    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
599 aa  1222    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
579 aa  653    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
576 aa  630  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
589 aa  608  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
589 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
581 aa  596  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
586 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
594 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
594 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
592 aa  595  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
600 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
590 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
602 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
585 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
608 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
590 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
594 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
593 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
593 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
603 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
597 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
619 aa  571  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
593 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
594 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
600 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 
601 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
595 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
600 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
593 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
594 aa  563  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
591 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
589 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
597 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
589 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
627 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
598 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
582 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
590 aa  555  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
591 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
591 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
591 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
591 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
591 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
588 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
591 aa  558  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
591 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
580 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
599 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
597 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
594 aa  554  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
606 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
594 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
610 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
599 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
617 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
602 aa  545  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
588 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
591 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
597 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
597 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
588 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
588 aa  545  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
591 aa  545  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
607 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
599 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
614 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
599 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
618 aa  539  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
600 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
592 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
592 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
614 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
598 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
597 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
599 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 
595 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  46 
 
 
601 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
604 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
601 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
626 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
591 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
591 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
582 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
595 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
586 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
590 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
599 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
602 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
603 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>