More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1620 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1353  aspartyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
579 aa  713    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000395014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 
579 aa  722    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  66.2 
 
 
576 aa  809    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
581 aa  1189    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 
599 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 
592 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
592 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
613 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
585 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
597 aa  551  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
588 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
594 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
594 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
590 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
610 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
597 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
596 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
600 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
591 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
591 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
591 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
589 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
597 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
591 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
587 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  47 
 
 
600 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
608 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
582 aa  537  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
595 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
593 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
590 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
581 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
627 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
586 aa  536  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
614 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
598 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
594 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
587 aa  534  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
594 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
606 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
600 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
593 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
595 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
595 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
582 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
588 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  48 
 
 
591 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
588 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
594 aa  532  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
599 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
588 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
593 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
597 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1122  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
577 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270961 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
597 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
597 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
589 aa  529  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
594 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  46 
 
 
593 aa  528  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
599 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
616 aa  527  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
598 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
597 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
589 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
599 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
592 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
593 aa  525  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
614 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
598 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
602 aa  523  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
599 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
618 aa  519  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
599 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1290  aspartyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
612 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
596 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2047  aspartyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
580 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0219169  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2080  aspartyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
591 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108911  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21621  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
612 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.403344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
597 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  0.000000115872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
599 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
594 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 
599 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000241226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
594 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1898  aspartyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0452698  hitchhiker  0.00737788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>