More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1067 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1067  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
587 aa  1188    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1137  aspartyl-tRNA synthetase  61.98 
 
 
597 aa  723    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000518109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
597 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
591 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
589 aa  591  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  585  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
591 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
591 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
589 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
594 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0153  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
592 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1217  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
582 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000515713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
593 aa  568  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
595 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
597 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
597 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
586 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 
593 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
588 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
588 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
597 aa  561  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
593 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
600 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
594 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
585 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
588 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
593 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
592 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
583 aa  556  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
617 aa  555  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
602 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0148  aspartyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
582 aa  552  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
600 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
613 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
583 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
598 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
594 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
592 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
594 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
599 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
597 aa  548  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
594 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
594 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4233  aspartyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
581 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.118029  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1248  aspartyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
583 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01940  aspartyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
582 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.425315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
594 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
600 aa  544  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
627 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
595 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
596 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
588 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
592 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
583 aa  544  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
596 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
608 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1620  aspartyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
581 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4606  aspartyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
589 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
600 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
597 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
592 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
589 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
590 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
614 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
583 aa  537  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
595 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1230  aspartyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
576 aa  536  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
610 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0814  aspartyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
582 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0829  aspartyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
582 aa  532  1e-150  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0763461  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
583 aa  534  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
599 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
617 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0464  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0196748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
590 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
588 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
583 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0111  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
616 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  535  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
590 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
590 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
590 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
590 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
590 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
590 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
596 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
599 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
590 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>