More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0649 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  87.14 
 
 
583 aa  1069    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  86.79 
 
 
583 aa  1064    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1086  aspartyl-tRNA synthetase  68.5 
 
 
580 aa  854    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.989132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  70.84 
 
 
582 aa  893    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0296  aspartyl-tRNA synthetase  74.57 
 
 
584 aa  921    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  87.14 
 
 
583 aa  1070    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  75.82 
 
 
584 aa  939    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  77.07 
 
 
585 aa  957    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
583 aa  1202    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
597 aa  631  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 
590 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 
591 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
606 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
594 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 
598 aa  624  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
610 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
591 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
617 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
591 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 
591 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
591 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
599 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
591 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
594 aa  608  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
627 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
614 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
591 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
591 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
588 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
588 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
599 aa  606  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
593 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
591 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
590 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
591 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
597 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
602 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
594 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
591 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
594 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
590 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
601 aa  599  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
599 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
592 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
588 aa  596  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
585 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
586 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
592 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
592 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
593 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
593 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
592 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
613 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
602 aa  592  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
591 aa  594  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
597 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
593 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
596 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
588 aa  589  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
601 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
592 aa  591  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
599 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 
599 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1203  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
608 aa  585  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000120939  decreased coverage  0.0042207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
598 aa  588  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
591 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
598 aa  588  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
595 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 
599 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
608 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000958333  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
600 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
590 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
590 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>