More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1086 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  68.5 
 
 		 583 aa  841    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 		 583 aa  847    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  68.5 
 
 		 583 aa  854    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  68.5 
 
 		 583 aa  841    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0296  aspartyl-tRNA synthetase  67.41 
 
 		 584 aa  819    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1086  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 580 aa  1191    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.989132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  74.66 
 
 		 582 aa  915    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  69.19 
 
 		 585 aa  851    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1196  aspartyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 584 aa  830    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 597 aa  622  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 591 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 594 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 591 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 597 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 585 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 599 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 617 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 598 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 614 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 593 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 590 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 627 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 610 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 597 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 606 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 590 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 591 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 598 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 605 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 592 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 593 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 591 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 595 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 600 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 592 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 623 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 623 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 599 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 592 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 613 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 596 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 601 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000444023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 601 aa  592  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000125703  unclonable  0.00000000115783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 604 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 605 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 599 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 591 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 591 aa  591  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 602 aa  591  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 596 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 592 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 603 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 600 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 600 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 603 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>